環境に生息する微生物へのアプローチとして,以前は個々の微生物を分離・培養し,その微生物が有する諸性質を明らかにしてきたが,次世代シーケンサーの登場により,培養を経ずに環境に生息する微生物を網羅的に解析することが可能となった。既に,土壌,海洋,河川,腸内や皮膚など様々な環境を対象とした次世代シーケンス解析が行われ,その膨大なデータを有効活用し,環境改善,健康,医療や創薬などに役立てる試みもはじまっている。次世代シーケンサー登場前後から微生物のゲノム解析に携わってきた経験を活かし,皮膚科学の分野で活躍する皆様に役立つことを心掛けながら,皮膚常在菌叢の解析方法や最近の知見などを紹介する。